Полное имя — Дженсен Росс Эклс.

У Дженсена ирландские, английские и шотландские корни.

Родился в семье актёра Алана Эклса и Донны Джоан Шеффер.

Родители назвали сына Дженсеном, так как считали это имя редким.

У Дженсена есть старший брат Джошуа (1975 г. р.) и младшая сестра Маккензи (1985 г. р.).

В 1990 году Дженсен Эклс окончил начальную школу Дартмут в Ричардсоне (Техас), затем он перешёл в среднюю школу Аполло, которую окончил в 1993 году, а закончил он среднее образование в школе Беркнера в 1996 году. После окончания школы Дженсен собирался поступать в Техасский университет на физиотерапевта, но потом решил стать актёром и переехал в Лос-Анджелес.

Первый опыт Дженсена на театральной сцене состоялся в июне 2007 года. Дженсен выступил на сцене театра «Casa Mañana» (Техас) вместе с Лу Даймондом Филлипсом в спектакле «Несколько хороших парней». Он сыграл роль лейтенанта Дэниэла Кэффи.

30 мая 2013 года у Дженсена и Дэннил родилась дочка Джастис Джей Эклс.