Продолжение приключений дигимонов. Наших славных героев ждёт встреча с новой, им неведомой, силой, которая способна уничтожить любого человека и дигимона внутри себя. А всё потому, что сердце этого дигимона черно, как ночь. Смогут ли Избранные остановить эту силу и растопить сердце злого дигимона?

Хадзимэ, Миюки и инспектор Кэммоти приглашены на церемонию открытия «Дома Оперы». Там они узнают, что в честь открытия будет показана новая постановка «Призрака оперы». Но очень скоро таинственный «Призрак» начинает убивать участников труппы одного за другим. Хадзимэ придется снова раскрывать дело об убийство в «Доме Оперы».

Short Peace посвящен взаимоотношениям человека с природой и техникой. В Tsukumo рассказывается история странника, пережидающего ночь в лесном святилище, переполненном духами. В Hi no Youjin показана работа пожарников в эпоху Эдо, когда японские города еще строились из бумаги и дерева. В Gambo от громадных пришельцев-троллей людей и лес защищает не менее громадный белый медведь. В Buki yo Saraba представлено постапокалиптическое будущее: в центре Токио из-под контроля людей выходит боевая машина, и на усмирение разбушевавшегося механизма высылается пятерка спецназовцев.

После полного солнечного затмения тёмная сила окутывает Землю, и воины в матросках вынуждены снова объединиться, чтобы вернуть миру свет.

Доктор Нэверс узнает о существовании зловещей расы палеоготов, звездная система которых находится на грани коллапса, и которые готовы начать колонизацию Земли. Чтобы защититься от гигантских монстров, насылаемых пришельцами, Нэверс создает проект Магнос, ключевую роль в котором играет боевой робот.

Мальчик Кун всегда был любим своими родителями, которые постоянно потакали его капризам. Но однажды всё изменилось. Всему виной стало появление маленькой сестрички Куна. В тот же момент родители переключили всё своё внимание на маленькую сестрёнку, что вызвало у Куна волну гнева и ярости. Как-то раз, чувствуя себя подавленным, мальчишка оказывается в необычном магическом саду. Оказалось, в этом саду можно осуществляться путешествия во времени. Мальчик понимает, что у него есть шанс изменить текущий ход событий. Впереди парня ждут невероятные приключения, которые помогут ему стать самым лучшим старшим братом для своей сестры Мирай.

В Киото из храмов стали пропадать статуи Будды. Однажды, девочка по имени Бенико обнаруживает своих родителей убитыми в их храме, а статуя Будды, которую они охраняли - пропала. Убитая горем, она переезжает к старому знакомому родителе - Эндзю. Но в храме Эндзю творятся странные дела.

Феодальная Япония. Между кланами Биакуро и Кабусу разгорелась война. Кабусу решили похитить маленькую принцессу клана Биакуро, которая, как предсказано, будет обладать силой, достаточной, чтобы захватить мир. Обеспокоенный планами врага клан Биакуро покидает свой замок. Несколько лет спустя шести молодым ниндзя из клана Биакуро предстоит сдать последний экзамен. Для этого им нужно тайно пробраться в их прежний замок и похитить "самый важный" свиток. Хранителем свитка станет тот, кто его принесёт. Экзаменующимся также известно, что одна из трёх девушек в их компании - принцесса, но кто именно, они не знают. То же самое узнаёт и клан Кабусу, а идея похитить принцессу их всё ещё не оставила...